作为侄子的朱允炆是先发制人在先的
靖难之役的历史背景
洪武三年（1370）四月，农民出身的朱元璋登基，为确保朱明王朝能够千秋万代地统治下去，他一方面加强君主专制统治，把军政大权牢牢地掌握在皇帝一人之手，另一方面，想方设法加强皇室自身的力量，其具体的办法就是分封诸王。
他把宗室二十五人（24个儿子和1个从孙）封为藩王，分驻北部边境和全国各战略要地，想通过他们来屏藩皇室。
朱元璋昭告说：“天下之大，必建藩屏，上卫国家，下安生民，今诸子既长，宜各有爵封，分镇诸国”。受封诸王在自己的封地建立王府，设置官属，地位相当高，公侯大臣进见亲王都得伏而拜谒，无敢钧礼。
每个藩王食粮万石，并有军事指挥权，于王府设亲王护卫指挥使司，辖军三护卫，护卫甲士少者3000人，多者1.9万人。九位边王（辽、宁、燕、谷、代、晋、秦、庆、肃）因有防御蒙古贵族侵扰的重任，所以护卫甲士尤多。
北平的第四子燕王朱棣拥兵10万，大宁的第十七子宁王朱权“带甲八万，革车六千”。他们在边塞负责筑城屯田、训练将兵、巡视要害、督造军器。晋王、燕王多次出塞征战，打败蒙元残余势力的军队，尤被重视，军中大将皆受其节制，甚至特诏二王军中小事自断，大事才向朝廷报告。
尤其是燕王，由于功绩卓著，朱元璋令其“节制沿边士马”，地位独尊。
藩王势力的膨胀，势必对中央政权构成威胁。在朱元璋大封诸王的时候，有个叫叶伯巨的大臣指出，藩王势力过重，数代之后尾大不掉，到那时再削夺诸藩，恐怕会酿成汉代“七国之乱”、西晋“八王之乱”的悲剧，提醒朱元璋“节其都邑之制，减其卫兵，限其疆土”。朱元璋不但听不进劝告，反而将其下狱囚死。
在分封之中，他曾规定凡受封诸王必须离开京城，到封地就藩。不允许各亲王之间相互往来，即使入朝，也不能同时前来，必须一王离京，另一王才可启程。朱元璋此举的目的在于避免诸王相互串联，与中央相对抗。所以，诸王就藩，可以说是“生离死别”。但朱元璋的用心良苦，却未能收到预期的后果。
建文帝朱允炆削藩
洪武二十五年（1392年）太子朱标病死，朱元璋虽立朱标的次子朱允炆为皇太孙。朱允炆因生性“颖慧好学，性至孝”，而深得朱元璋的喜爱，称赞他：“而诚纯孝，顾不忘我乎。”不过，对于这位“仁柔少断”的皇太孙将来继任帝位，朱元璋并不十分满意，曾一度打算更换太子，后因翰林学士刘三吾的劝谏，才没有这样做。
尽管如此，朱元璋对朱允炆的继位仍放心不下。洪武三十一年（1398）闰五月，朱元璋病故，庙号太祖，皇太孙朱允炆即皇帝位。
临终前，朱元璋立下遗诏，“皇太孙允炆仁明孝友，天下归心，宜登大位。内外文武臣僚同心辅政，以安吾民”、“诸王临国中，毋至京师”。
朱允炆即位，是为明惠帝，改元建文。尽管有朱元璋的遗诏，不许诸王“入临、会葬”，但燕王朱棣仍直奔京城建康（今江苏南京），朱允炆闻讯后，立刻派人持敕，令朱棣返回燕京，对此朱棣十分不悦，这是阻止我们尽孝啊。
其时，镇守北部边疆的诸王已有很大的权势，宁王朱权“带甲八万，革车六千”。燕王朱棣更握有“节制沿边士马”的重权。朱允炆对这些皇叔们忧心忡忡。
建文元年（1399）正月，朱允炆即位不久，燕王朱棣即遣长史葛诚入朝奏事。
朱允炆遂向葛诚密问燕王府之事，葛诚如实禀告，于是派他返回燕王府，作为内应。葛诚回到燕王府，朱棣见他神色异常，心中不免作疑。随即朱棣亲自入朝，他自恃皇叔身份，径直走皇道入宫，登陛不拜。
监察御史曾凤韶弹劾其不敬，户部侍郎卓敬也密奏，以燕王“智虑绝人”，建议将他徙封至南昌，但都被朱允炆以“骨肉至亲”，婉言拒绝。朱棣察觉到朝廷对自己怀有贰心，回燕王府后，便托辞患病，以观事态的变化。
基于此，建文帝与兵部尚书齐泰、太常卿黄子澄商量，齐泰、黄子澄以诸王权势过大，恐难驾驭为由，力主削藩。
在削藩顺序上，齐泰认为应先削实力最强的燕王，但黄子澄反对，认为燕王有功无过，为了争取舆论支持，应该先找有问题的亲王下手。惠帝支持黄子澄，遂先后废除五位亲王。
洪武三十一年七月，削周王。因周王是燕王同母兄弟，而朱允炆怕他与燕王沆瀣一气，于是决定先废周王。时周王次子朱有爋告发其父谋反，于是派曹国公李景隆以备边之名经过开封，将周王全家押回南京，废为庶人，迁往云南蒙化（今昆明以西、大理以南）。
建文元年（1399年）四月，削齐、湘、代三位亲王，直接废为庶人。湘王不堪受辱，为保名节举家自焚；齐王被软禁在南京；代王被软禁在封地大同。 两个月后，削岷王，废为庶人，徙漳州。
朝廷削藩直接激化了矛盾，藩王与朝廷开始决裂，此时实力最强的燕王就成了真正的众藩之首。而朱允炆与朱棣之间的博弈亦逐渐激化。
按照朱元璋设计的制度，由皇帝、藩王、外戚、驸马组成的家天下体制，应该能够在权力、礼法和亲情的共同作用下稳固地支持大明江山。然而，文弱的朱允炆与身边的书生们没想出掌握并制约桀骜不驯的叔王的办法，于是朱元璋最初设计的制度终于酿成大祸。
与此同时，朱允炆朝廷也开始实施针对燕王的措施，在北平周围及城内部署兵力，又以防边为名，把燕王朱棣的护卫精兵调出塞外戍守，准备以此削除燕王。
以上种种，建文帝以为准备妥当了，便秘密下令擒拿朱棣，但却没有成功。
发展到这一步，坐镇北平的朱棣已成困局，再不起兵必步被削藩王的后尘， 于是1399年（建文元年）燕王正式起兵反抗，随挥师南下，史称“靖难之役”。
在这场战争中，皇亲国戚们纷纷参战，投向不同的两个阵营。
靖难之役
靖难之役中朱棣的口号是“清君侧，靖国难”。“靖难”的意思：“靖”指平息，扫平，清除。“靖难”代表平定祸乱，平息战乱，扫平奸臣的意思。
太祖朱元璋成法中有一条是关于“靖难”的。
为了保证朝廷的正常，如果出现奸臣乱政的情况，藩王可以带兵入京勤王，以“清君侧，靖国难”。朱棣抓住了这个由头，发动了“靖难之役”。
不过太祖的成法里还有一条就是皇帝必须先召唤藩王，藩王才能起兵，且成功铲除奸臣后要五日之内离京。
所以这不过是朱棣想要夺取皇位的一个借口罢了。
朱元璋为保皇孙朝廷稳固，临终前已将所有能威胁到朱允炆政权的人全部杀光，除了自己的儿子，但百密一疏，这直接导致了建文帝朝廷已无大将可用，燕王起兵后，只好起用幸存的老将耿炳文统兵北伐，又派李景隆继续讨伐。
而建文帝本缺乏谋略，优柔寡断，致使主力不断被歼。
朱棣以北平（今北京）为基地，适时出击，灵活运用策略，经几次大战经逐渐消灭了官军主力，最后乘胜进军，于1402年（建文四年）攻下帝都应天（今江苏南京） 。
战争共历时四年（1399—1402年）。 南京破后，建文帝下落不明。或说于宫中自焚死，或说由地道逃走，隐藏于云、贵一带为僧。
同年，朱棣即位，即明太宗，嘉靖时期改为明成祖。
第二年，改元永乐，改北平为北京。1421年，迁都北京，称北京为京师，南京为留都。
洪武年间，北方的防务多由几位边王（如朱棣、朱权）负责，靖难后，朱棣迁诸边王于内陆，导致华北防务空虚；
受教于唐朝之守外虚内、宋朝之守内虚外的教训，故在军事上，定都金陵（南京）、遥控将领守卫边界的风险很大；而“天子守国门”则可以解决这一问题。另一方面，由于南京建文帝前朝制度影响较大，在政治上考虑，作为朱棣大本营的北平更加适合作为帝都。故考虑各种因素后，朱棣决定迁都北京。
永乐元年（1403年）二月，朱棣改北平为北京，名顺天府， 随后迁徙各地富民于北京 。
朱棣称帝后，六月十八，恢复了周王朱橚、齐王朱榑的爵位 。随后恢复代王朱桂、岷王朱楩的爵位。永乐元年正月，令周、齐、代、岷四王重新归藩。
六月廿六，朱棣取消朱标的明兴宗庙号，重新称懿文太子 ；七月十二，将朱允炆的三个弟弟由亲王降为郡王；十一月将朱允熥、朱允熞废为庶人，朱允熙不久暴卒 。
朱棣因为反对惠帝削藩而起兵，为了争取诸王拥戴，即位后立即恢复了被削的藩王，并加以赏赐，甚至改变祖制给予宗室更高的品级。
“靖难之役”是明朝历史上第一场皇帝和藩王之间的内战。这场战争是因为建文帝朱允炆为了巩固自己的权力、决定削藩而引起的。
“靖难之役”是明朝历史上影响深远的一次政权争夺战，不仅导致了明朝皇位归属的改变，也极大影响了此后二百多年明朝政治、思想的走向。
