袁崇焕被生性多疑、刻薄寡恩的崇祯帝所杀。根据史料记载，崇祯帝杀掉袁崇焕 ，等于帮了劲敌后金的一个大忙 ——袁冤死后，在随后辽东发生的一系列重大战役中，明军再也没有取胜过。从这里我们也可以清楚地看到，袁崇焕是明末时的国家栋梁，边防柱石。崇祯擅杀忠良，如同自毁长城。袁被冤杀，预示着大明的国运也即将走到尽头。
天启三年（1623年）9月，谋勇兼具的袁崇焕被兵部尚书孙承宗赏识、器重，奉命出关构筑宁远城，后被攫升为右参政、按察使职，仍然驻守宁远 。 天启六年（1626年）正月，后金“战神” 努尔哈赤亲率十余万满汉精锐围攻宁远，袁崇焕临危不惧，指挥若定，集众坚守，在城头架起西洋巨炮（采购自荷兰的“红夷大炮”），发炮轰击，后金军伤亡惨重，溃不成军，努尔哈赤中炮负重伤，大败而归。袁崇焕文人掌军，却取得了宁远大捷，积功晋升兵部左侍郎。
天启六年（1626年）八月，被袁崇焕击伤的后金豪酋努尔哈赤伤重不治，含恨而亡。不久，袁崇焕再次击退后金军的凶猛进攻，取得了“丁卯之役”的大胜。
袁崇焕
天启七年（1627年）四至六月，袁崇焕率赵率教、满桂、祖大寿、毛文龙、刘应坤、毕自肃等将领，配合蓟辽总督阎鸣泰挫败了皇太极的大举进攻，取得了著名的“宁锦大捷”。
千里救援，却被猜忌
《明史》记载，“宁锦大捷”后，满桂、赵率教等将领都得到朝廷厚赏，并加官进爵，但袁崇焕却因为曾向皇太极议和以及被魏忠贤嫉恨，魏唆使其亲信弹劾他拒救锦州而没有论功行赏，只给他增加了一级官阶 。
功高而不赏，袁崇焕愤懑不平，遂主动辞官归里。 天启七年（1627年），朱由检即位，是为明思宗，亦称崇祯皇帝。崇祯即位后召回袁崇焕，次年（1628年）四月以兵部尚书兼右副都御史督师蓟辽。崇祯二年（1629年）10月 ，皇太极率八旗劲旅侵入明境，因数次败于袁崇焕之手，对其畏惧异常，不敢直攻宁远，而绕道喜峰口经内蒙兵分三路，连克龙井关、遵化，兵临北京城下。
袁崇焕闻讯，未得诏命，立刻率军千里回师救援。千里驰援的袁崇焕不顾疲惫，一到京郊立刻进击清军，在广渠门和广安门外两次击败皇太极。皇太极在军事上不是袁崇焕对手，于是采纳汉人谋士范文程之计，想方设法除掉袁崇焕。
皇太极用反间计挑拨崇祯皇帝与袁崇焕的矛盾。刚愎自用、猜疑忌刻的崇祯帝果然中计。崇祯帝疑心袁与皇太极有密约，双方图谋攻取北京，签了城下之盟，于是决定召见并诱捕袁。
朱由检
崇祯帝以“议军饷” 为由召袁崇焕入城。原来，宁远军千里来援，在京郊奋战了十几天，军无余粮，马无草料，数九寒天，凄风苦雨，露宿旷野，苦不堪言。袁崇焕听说崇祯帝召他进城“议军饷”，很高兴，想也没想就进城来到紫禁城。
忠良被磔，万古奇冤
接下来发生的事也算妇孺皆知了。袁崇焕见到崇祯帝后，什么都没来得及说，就被武士剥掉官服，并当堂逮捕了，崇祯帝让他下锦衣卫大狱，并严加审讯。
《明实录》记载，崇祯三年（1630年 ）八月十六日，大明兵部尚书、蓟辽总督袁崇焕，惨遭磔刑，含冤负屈而死。那么，大明国防中坚、满清劲敌袁崇焕究竟犯了什么罪？且看看六部六卿（其实是崇祯帝）给他定的九大罪状：一、付托不效；二、专恃欺隐；三、市米资盗；四、谋款诱敌；五、擅杀岛帅（毛文龙）；六、纵敌长驱；七、顿兵不进；八、遣散援兵；九、携僧入城。简直是欲加之罪，何患无辞？崇焕何罪？莫须有也！
史载，崇祯以“通敌叛国”罪处死蓟辽总督袁崇焕，凌迟行刑前，观者如堵，开膛破肚，骨肉俱尽，京师愚夫愚妇们争啖其肉，最后只剩头颅，还要传视九边；兄弟妻妾均遭流放，家产被抄没入官，朝野山呼万岁，自然无人替他鸣冤叫屈。直到七十年后的康熙四十一年（1702年），康熙帝授意清廷内务府公布了皇太极的密谋，《清太宗实录》、《明史纪事本末》、《啸亭杂录》等文献对这一冤案均有详细记载—— 崇祯帝误中皇太极反间计，轻信被建州女真人遣回被俘的杨春、王成德二太监，以为袁崇焕与后金订有密约，故意勾引八旗军入侵关内。康熙帝肚量还算宽宏，倘若他不泄露这一机密，后世一定会把袁崇焕当大汉奸看待 ，他也因此会被钉在历史的耻辱柱上永世不得超生。康熙帝之所以敢于将此机密大白于天下，是因为满清入关后大局已定，统治已经稳固，表彰忠臣义士（即便是敌对方的），更有利于凝聚民心、稳定政局。
